Also ich habe es gerade zum Test mal ausprobiert und bei mir landete der Inhalt meiner .nfo auch in der XML.
Im Watch-Folder 1 Ordner mit test.rar und test.nfo und der Inhalt der .nfo wurde übernommen. Die Kodierung hat es eventuell zerhauen, aber auch das würde ich nicht auf die Patched-Version schieben.

Hast du das richtige Profil bearbeitet, mit dem du arbeitest? Und am Ende auch auf Speichern geklickt?
Ansonsten könntest du noch unter intellitool/configfiles/profiles die passende .xml die ansehen, ob dort auch "<nfotoxml>-1</nfotoxml>". Die -1 kommt vermutlich von Delphi, die "wahr" ein wenig anders umwandeln, aber "falsch" ist immer noch "0".