Ich wäre da vorsichtig die HDD unter Windows einfach platt zu machen.
Dein NAS verwendet ziemlich sicher BTRFS oder EXT4 als Dateisystem, diese beiden Dateisysteme kannst du unter Windows gar nicht out-of-the-box lesen.
Dann ist klar, dass Windows meckert und dir anbietet die Platte zu formatieren.
Falls die Platte dann noch in einem RAID war oder du LVM verwendet hast, ist das nochmal ein Grund mehr nicht unter Windows zu prüfen, was mit der Festplatte los ist.
Häng die platte an den Windows Rechner und boote mit einem USB-Stick irgend eine Live-Distro (Debian oder Ubuntu z.B.) dann kannst dir dort anschauen, ob die Platte bzw. das Dateisystem defekt ist und es ggf. reparieren, bevor du jetzt einfach direkt formatierst und am Ende womöglich noch Daten verlierst.
Edit: nachdem ich mir die Mühe gemacht hab, seh ich erst jetzt das du die Festplatte ja schon im NAS formatieren wolltest. Nichtsdestotz würde ich die das Live System empfehlen, da hast du gleich die richtigen Tools (fdisk) um die Platte sauber zu formatieren und eine neue Partition zu erstellen.
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