Genauso bei sudo do-release-upgrade - dort sollte auch alles erhalten bleiben, nur solltest du halt wie gesagt schon ein Backup der Maschine/deiner Daten gemacht haben, bevor du das ausführst.
Was du dringend beachten solltest ist diese Zeile aus der Anleitung des Upgrade Prozesses von Ubuntu (https://wiki.ubuntuusers.de/Upgrade_auf_Xenial/):
Im Laufe des Upgrades ist es wahrscheinlich, dass die Netzwerkverbindung zumindest kurzzeitig unterbrochen wird. Führt man daher ein Upgrade auf einem Server durch, zu dem man nur via SSH Zugang hat, so wird man die Kontrolle über den Aktualisierungsprozess verlieren, da die SSH-Sitzung unterbrochen wird. Führt man also die Installation auf einem entfernten Rechner durch, so sollte man sie innerhalb von Screen starten. So besteht die Möglichkeit, die Verbindung wieder aufzunehmen und den Vorgang so wieder zu steuern.
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