Ein Script im Terminal laufen lassen OK, mal versuchen zu antworten. Man kann jedes Desktop, was für den Linux geeignet ist nehmen und nachinstallieren. Wenn du willst kannst du sogar alle grafischen Umgebungen installieren, aber nur eins immer nur aktuell benutzen. Du brauchst, also was einfaches zum Klicken, dann schaue dir mal IceWM an.
Dein Script soll 24/7 Stunden laufen kein Problem (einen Script zur Überwachung aktivieren). Ich kenne das Zoom Programm nicht, aber warum machst du dies nicht mit z.B. Duplicity (grafisch) und nach dem Update, lässt du das Verzeichnis löschen.