Nein, weiß ich leider nicht, daher nur der Tipp, woher so ein Verhalten vermutlich kommt.
Ich bin mir ehrlich gesagt nicht sicher, wo die Steuerzeichen herkommen und was sie genau zerpflückt.

Ich habe leider gerade keine vBulletin DB/Installation bequem zur Hand und kann das daher nicht ausprobieren.
Eventuell genügt es schon in der Ausgabe alle Vorkommen von "\r" zu ersetzen. Zum Beispiel in der MySQL-Abfrage oder vor der Ausgabe.
Eventuell funktioniert auch etwas wie SELECT INTO OUTFILE besser.